Desenvolvidos em colaboração com especialistas em genómica do cancro, estes oligos pré-concebidos e prontos a utilizar permitem aos investigadores sequenciar uma variedade de genes e polimorfismos de nucleótido único (SNP) anteriormente associados à predisposição para o cancro.
Tem como alvo 94 genes e 284 SNPs associados a uma predisposição para o cancro
O TruSight Cancer inclui genes associados a cancros comuns (por exemplo, da mama, colorrectais) e raros. Além disso, o conjunto inclui 284 SNP que se verificou estarem correlacionados com o cancro através de estudos de associação do genoma (GWAS). A seleção de conteúdos baseou-se na curadoria de peritos da literatura científica e de outros recursos de elevada qualidade.
O painel de sequenciação TruSight Cancer fornece oligos personalizados que visam regiões de interesse identificadas. É fornecido um produto suficiente para quatro reacções de enriquecimento. O TruSight Cancer é compatível com o TruSight Rapid Capture.
Conjuntos de dados de amostras TruSight Cancer
foram preparadas 6 amostras de referência humanas utilizando o painel de sequenciação TruSight Cancer. Essas bibliotecas foram sequenciadas no sistema MiniSeq usando um kit de alto rendimento em uma configuração de comprimento de leitura de 2 x 100 bp com indexação dupla. O rendimento total foi de 5,2 Gb com 95,8% de bases iguais ou superiores a Q30.
Especificações
Tempo do ensaio - 1,5 dias
Tipo de cancro - Pan-cancro
Especificações de conteúdo - Conjunto fixo de sondas que enriquecem 94 genes e 284 SNPs associados a cancros comuns e raros.
Descrição - Pesquisa de deteção de mutações na linha germinativa para cancros comuns e raros.
Tempo prático - 5 horas
Quantidade de entrada - 50 ng de ADN
Instrumentos - Sistema MiSeq, Sistema NextSeq 550, MiSeqDx em modo de investigação, Sistema MiniSeq, Sistema NextSeq 500
Método - Sequenciação de ADN orientada, enriquecimento de alvos
Multiplexação - Até 96 plexos
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