Módulo de software para sequenciamento HLA SEQNEXT-HLA

de laboratóriode análisede mapeamento

A SEQNEXT-HLA é uma aplicação poderosa e de fácil utilização para a análise de dados de digitação baseados em sequência HLA de todas as plataformas e kits comuns de sequenciação da Próxima Geração. Todas as versões da base de dados IMGT HLA estão disponíveis para download e importação. Para o cálculo de resultados, as sequências intron podem ser consideradas para excluir alelos nulos, além disso, a faseamento pode ser verificada. Podem ser mostradas advertências para coberturas e fundo. Também são chamados novos alelos. O resultado pode ser exibido no máximo, 1 campo ou 2 de resolução de campo e como código NMPD. Todos os dados dos resultados podem ser transferidos para sistemas LIM internos do laboratório e/ou emitidos como relatórios personalizados de pacientes. Compatível com dados de todas as plataformas e kits de sequenciação da Próxima Geração comuns Configuração fácil de regiões-alvo individuais (ROIs) com base na base de dados IMGT HLA Análise de fastq- ou fastq.gz-files Padrões eficientes para cartografia, alinhamento, qualidade e chamada de alelo Configurações configuráveis para chamadas alelo Análise de loci completos (tanto de dados exon como de intron) Detecção/exclusão de alelos nulos com base em sequências de intron Verificação por fases para eliminar ambiguidades Detecção de novos alelos