O nosso kit DepleteX High Expressing RNA Depletion remove as transcrições de maior expressão in-vitro antes da sequenciação, redistribuindo ~70%* das leituras de sequenciação para transcrições únicas biologicamente relevantes - permitindo-lhe maximizar a deteção de transcrições de baixa expressão ou isoformas raras.
Aumentar a sensibilidade de deteção em fibroblastos e sangue total
A ressequenciação de transcrições de elevada expressão acrescenta pouca informação biologicamente relevante. Infelizmente, estas transcrições competem com as transcrições de baixa expressão pela cobertura da sequenciação. Esta falta de cobertura, juntamente com o ruído significativo das transcrições de elevada expressão, limita a deteção dos genes de baixa expressão, das variantes raras e dos eventos de fusão únicos que podem ser factores de doença.
O DepleteX utiliza Cas9 e um conjunto de RNA-guia concebido para remover 70% das transcrições com maior expressão de bibliotecas de RNA-Seq selecionadas com poli-A derivadas de fibroblastos e sangue total. Este conjunto de guias foi concebido para maximizar a reatribuição do total de leituras de sequenciação para aumentar a cobertura de sequenciação de transcrições raras, de baixa expressão e de eventos de fusão únicos.
Destaques
Elimina >4.000 transcrições altamente expressas em sangue total e fibroblastos
Atribuir ~70%* mais leituras a transcrições biologicamente relevantes com baixa expressão
Maximizar a deteção de variantes e isoformas com menos sequenciação
Aumento da deteção de transcrições com menor expressão
Integra-se facilmente no seu fluxo de trabalho com um protocolo simples e flexível
Sobre o
O kit inclui RNA guia e reagentes de depleção para depleção pós-biblioteca.
Especificação
Amostras por kit - 24
Tecidos avaliados no projeto - Fibroblastos, sangue total
Conteúdo de depleção - ~4.450 transcrições de elevada expressão
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