O painel de depleção de ARN DepleteX remove as transcrições de insulina com maior expressão in-vitro antes da sequenciação, redistribuindo os clusters de sequenciação para transcrições únicas biologicamente relevantes - permitindo-lhe maximizar a UMI e a sensibilidade genética.
Para além da ribodepleção, as amostras de ARN têm normalmente um pequeno número de transcritos altamente expressos e bem caracterizados, e a re-sequenciação destes transcritos acrescenta pouca informação biologicamente relevante. Infelizmente, estes transcritos altamente expressos competem com os transcritos de baixa expressão pela cobertura da sequenciação. Esta falta de cobertura de sequenciação, juntamente com o ruído significativo das transcrições com elevada expressão, limita a deteção de genes com baixa expressão, variantes raras e eventos de fusão únicos que podem ser factores de doença.
Destaques
Painel de insulina concebido para eliminar transcrições de sobreexpressão em amostras de pâncreas
Reatribuir leituras de sequenciação a transcrições com menor expressão para aumentar a cobertura
Maximizar a deteção de variantes e isoformas com menos sequenciação
Sobre o
O kit contém RNA guia específico do tecido e reagentes de depleção para depleção pós-biblioteca
Especificação
Amostras por kit - 24
Tecidos avaliados no projeto - Pâncreas
Concebido para depletar - 2 genes da insulina
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