Dentro do Sistema de Gerenciamento de Resíduos, o ar entra na abertura de trabalho da unidade e passa pelos portos de disposição, capturando o particulado gerado pelo esvaziamento das gaiolas. O ar é então puxado através de um sistema de pré-filtro de dois estágios, passa através do filtro HEPA de terceiro estágio (99,99% eficiente até 0,3 micron de partículas) e é devolvido à sala na base traseira da unidade. O material de cama e os resíduos animais passam por portos em forma de funil, onde são canalizados para sacos duplos de plástico forrados a sacos ou caixas queimadoras forradas a polivinil. Os sacos ou caixas podem ser selados na unidade antes da remoção do sistema.
O acesso é fornecido dentro do capô para selar os recipientes antes da remoção. Esta funcionalidade proporciona uma exposição reduzida do pessoal a alergénios.
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