Método de análise custo-eficiente de expressão gênica
para o rastreio de projectos
O agrupamento antecipado e o processamento em lote poupam tempo sem esforço
Facilmente escalável de algumas a 36.864 amostras
QuantSeq-Pool é a solução ideal para perfis de expressão gênica para grandes projetos de triagem usando código de barras de amostra, agrupamento precoce e processamento em lote de até 96 amostras em uma única reação, proporcionando um fluxo de trabalho facilmente escalável para multiplexação de até 36.864 amostras.
Alta Especificidade de Fios
O QuantSeq-Pool mantém uma especificidade excepcional de fios >99,9 % e permite mapear leituras para os fios correspondentes no genoma, permitindo a descoberta e quantificação de transcrições antisensoriais e genes sobrepostos.
Contagem Direta para Quantificação da Expressão do Genoma
Apenas um fragmento por transcrição é produzido; portanto, não é necessária a normalização do comprimento. Isto permite uma determinação mais precisa dos valores de expressão gênica e torna o QuantSeq a melhor alternativa aos microarrays e RNA-Seq convencionais nos estudos de expressão gênica.
Análise Bioinformática Simples
A leitura do mapeamento é simplificada ao saltar a detecção da junção. As leituras são geradas no extremo mais 3′ das transcrições, onde quase nenhum cruzamento é localizado. O processamento de dados pode, portanto, ser acelerado usando, por exemplo, Bowtie2 em vez de TopHat2.
Identificadores Moleculares Únicos
Os UMIs são incorporados para o QuantSeq-Pool e são introduzidos logo no primeiro passo do protocolo. Os UMIs têm 10 nucleotídeos de comprimento e são lidos no início da leitura 2. Use a informação do UMI para identificar duplicados de PCR e eliminar o viés de amplificação.
---