mRNA-Seq incluindo seleção de poli(A)
Ampla gama de entrada de RNA total (1 ng a 1 μg)
Fluxo de trabalho tudo-em-um fácil
Da selecção de poli(A) a bibliotecas prontas para a sequência em 5,5 horas
Unique Molecular Identifiers (UMIs) incluídos
12 nt Índices duplos únicos (UDIs) incluídos
O Kit CORALL mRNA-Seq Library Prep Kit permite a geração rápida e rentável de bibliotecas com a etiqueta UMI, com indexação dupla e exclusivas para análises de RNA de poli(A) transcriptoma inteiro utilizando as plataformas Illumina® NGS.
Cobertura Superior Ponta-a-Ponta
A cobertura abrangente do CORALL proporciona uma melhor transcrição da representação do início e do fim do site. A cobertura de leitura foi analisada usando os controles de pico de inserção do ERCC, que apresentam locais de início e fim de transcrição precisos e conhecidos (TSS e TES, respectivamente). CORALL lê o mapa com mais precisão para o TSS ERCC exato (Fig. 3A) do que as bibliotecas concorrentes, que não cobrem os verdadeiros locais de início. Além disso, CORALL fornece uma cobertura elevada em TES (Fig. 3B).
Análise de dados
Um Pipeline de Análise de Dados está agora disponível na BlueBee® Genomics Platform. O pipeline fornecido permite aos usuários do kit realizar o controle de qualidade de leitura, mapeamento, deduplicação do Identificador Molecular Único (UMI) e quantificação da transcrição. Para usar seu código de ativação, registre uma conta na BlueBee (https://lexogen.bluebee.com/portal) e carregue seus dados (arquivos fastq.gz).
NOTA! BlueBee Data Analysis está disponível para uma variedade de espécies, por favor consulte a FAQ 7. Genomas de referência para novas espécies podem ser adicionados mediante solicitação. Por favor, note que isto irá incorrer numa taxa. Veja Análise de Dados CORALL, para mais detalhes.
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