Kit de reagentes em solução QuantSeq

para preparação de amostrasNGSpara ácidos nucleicos

Análise custo-eficiente da expressão gênica em todo o genoma Economizando a profundidade da sequência gerando apenas um fragmento por transcrição Protocolo tudo-em-um rápido e simples: menos de 4,5 horas Adequado para amostras de baixa entrada (1 ng de RNA total) e FFPE Gasoduto gratuito de análise de dados para não-bioinformáticos UMIs para detecção de duplicados de PCR disponíveis NOVO! Pacotes com até 384 Índices Duplos Únicos (UDIs) O QuantSeq FWD Kit é um protocolo de preparação de bibliotecas concebido para gerar bibliotecas compatíveis com Illumina de sequências próximas da extremidade de 3' de RNA poliacrilado. O FWD QuantSeq contém a seqüência de ligação Illumina Read 1 no primer da síntese do segundo strand, portanto as leituras NGS são geradas em direção à cauda do poli(A), refletindo diretamente a seqüência mRNA (ver fluxo de trabalho). Esta versão é o padrão recomendado para análise de expressão gênica. Além disso, o Lexogen fornece uma versão de alto rendimento com indexação dupla opcional (índices i5 e i7), permitindo que até 9.216 amostras sejam multiplexadas em uma faixa. Mapeamento dos sites finais da Transcript Utilizando leituras mais longas, o FWD QuantSeq permite localizar com precisão a extremidade de 3' de RNA de poli(A) (ver Figura 3) e, portanto, obter informações precisas sobre o UTR de 3'. Análise de amostras de baixa entrada e baixa qualidade A quantidade de entrada recomendada de RNA total é tão baixa quanto 1 ng. QuantSeq é adequado para reproduzir bibliotecas a partir de RNA de baixa qualidade, incluindo amostras de FFPE. Ver Fig.1 e 2 para uma comparação de duas qualidades diferentes de RNA (FFPE e crio-bloco fresco congelado) da mesma amostra.