envolvendo 49 genes relacionados com a carcinogénese e supressores de tumores, com sondas que cobrem aproximadamente 25 Kb do genoma.
Este painel foi concebido para ser utilizado com o sistema de captura híbrida μCaler. Com base no novo sistema de enriquecimento direcionado μCaler, o μCaler HotSpot Panel v1.0 proporciona uma melhor eficiência de captura, um desempenho de captura consistente e excelente e reduz significativamente o tempo experimental, permitindo uma sequenciação mais eficiente e poupanças de custos.
As amostras de ARN podem ser utilizadas diretamente para a preparação de bibliotecas com este kit?
Não. Este kit é compatível apenas com gDNA ou cDNA como amostras iniciais. Para amostras de ARN, é necessária a transcrição inversa para gerar cDNA antes da preparação da biblioteca.
Qual é o intervalo de entrada recomendado? Como lidar com entradas que excedam este intervalo?
Este kit suporta 50-2.000 ng de gDNA ou cDNA. Se a quantidade de entrada exceder 2.000 ng, dividir a amostra em várias reacções para manter a eficiência da amplificação.
Qual é o tamanho da inserção deste kit? Como selecionar o comprimento da leitura de sequenciação?
O pico principal dos produtos PCR utilizando este kit é de ~270 bp. A sequenciação PE150 é recomendada para uma cobertura de alta qualidade.
qual é o volume de dados de sequenciação recomendado para a análise do repertório imunitário IGTR?
Recomenda-se um mínimo de 0,3 Gb para detetar clones a 0,01% de abundância com uma entrada de 200 ng. Aumente o volume de dados para aumentar a sensibilidade para clones de baixa frequência.
Este kit é adequado para a monitorização da doença residual mínima (DRM)?
Sim. Este kit inclui IG Primer Mix e TR Primer Mix com primers específicos do gene fornecidos em tubos separados, permitindo uma combinação flexível numa única reação de amplificação.
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