O NEXome Plus Panel v1.0 é um painel melhorado de captura do exoma completo. Alarga as regiões-alvo ao esqueleto SNP de todo o genoma, às regiões intrónicas relacionadas com a fusão comum de genes em tumores sólidos e aos loci clássicos de microssatélites com base no NEXome Core Panel, que abrange uma região de 43,3 Mb do genoma humano.
Esqueleto SNP de todo o genoma
Com base na base de dados 1000 Genomes, seleccionamos principalmente >9.000 loci com valores MAF elevados e elevada heterozigotia na população chinesa, cobrindo todo o genoma humano em intervalos de aproximadamente 300 Kb. Fornece informações mais ricas e mais uniformemente distribuídas sobre a composição genómica com base no exoma completo e pode ser utilizada para a deteção de CNV e perda de heterozigotia.
Loci clássicos de microssatélites
O NEXome Core Panel abrange um grande número de loci de microssatélites, e a adição de 15 loci clássicos MSI concebidos de forma optimizada facilita a comparação entre diferentes métodos analíticos de instabilidade de microssatélites, bem como a otimização e calibração do processo analítico.
As amostras de ARN podem ser utilizadas diretamente para a preparação de bibliotecas com este kit?
Não. Este kit só é compatível com gDNA ou cDNA como amostras iniciais. Para as amostras de ARN, é necessária a transcrição inversa para gerar cADN antes da preparação da biblioteca.
Qual é o intervalo de entrada recomendado? Como lidar com entradas que excedam este intervalo?
Este kit suporta 50-2.000 ng de gDNA ou cDNA. Se a quantidade de entrada exceder 2.000 ng, dividir a amostra em várias reacções para manter a eficiência da amplificação.
Qual é o tamanho da inserção deste kit? Como selecionar o comprimento da leitura de sequenciação?
O pico principal dos produtos PCR utilizando este kit é de ~270 bp.
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