Reagente em solução NEXome

Com base na última versão da Refseq (109, 2021) e na base de dados CCDS, o NEXome Core Panel selecionou cuidadosamente algumas regiões que merecem atenção fora da base de dados. Ao mesmo tempo, com base em considerações de continuidade do produto, foram mantidas algumas regiões eliminadas na última versão da base de dados. O NEXome Core Panel contém aproximadamente 400.000 sondas de ADN de cadeia simples sintetizadas e inspeccionadas independentemente quanto à qualidade, visando uma região genómica de 34,7 Mb (19.613 genes). O NEXome Core Panel é um painel central para todos os exomas que pode ser combinado com diferentes painéis de spike-in para satisfazer diferentes requisitos de aplicação. Produção e controlo de qualidade Sintetização independente e inspeção independente da qualidade As amostras de RNA podem ser utilizadas diretamente para a preparação de bibliotecas com este kit? Não. Este kit é compatível apenas com gDNA ou cDNA como amostras iniciais. Para amostras de ARN, é necessária a transcrição inversa para gerar cDNA antes da preparação da biblioteca. Qual é o intervalo de entrada recomendado? Como lidar com entradas que excedam este intervalo? Este kit suporta 50-2.000 ng de gDNA ou cDNA. Se a quantidade de entrada exceder 2.000 ng, dividir a amostra em várias reacções para manter a eficiência da amplificação. Qual é o tamanho da inserção deste kit? Como selecionar o comprimento da leitura de sequenciação? O pico principal dos produtos PCR utilizando este kit é de ~270 bp. A sequenciação PE150 é recomendada para uma cobertura de alta qualidade. Qual é o volume de dados de sequenciação recomendado para a análise do repertório imunitário IGTR? Recomenda-se um mínimo de 0,3 Gb para detetar clones a 0,01% de abundância com uma entrada de 200 ng. Aumente o volume de dados para aumentar a sensibilidade para clones de baixa frequência.