O NEX-t Panel v1.0 visa uma série de sequências caraterísticas selecionadas a partir dos genomas de centenas de agentes patogénicos, incluindo vírus, bactérias, fungos e parasitas. Abrange uma vasta gama de conteúdos, incluindo 16S/ITS, genes de manutenção, genes relacionados com a resistência aos medicamentos e muito mais.
Desempenho
Design inovador e único
O painel NEX-t v1.0 é constituído essencialmente pelos três componentes seguintes:
(1) Sondas concebidas para sequências caraterísticas de centenas de espécies, incluindo vírus, bactérias, fungos e parasitas, conforme listado na Tabela 1.
comparação de múltiplas sequências de referência dentro de espécies ou géneros, selecionando regiões dentro do intervalo de tolerância da sonda e contendo um certo grau de diversidade.
incorporação de sequências envolvidas na tipagem de sequências de múltiplos focos (MLST).
integração da literatura relevante.
(2) Um pequeno conjunto de sondas universais concebidas para 16S/ITS.
● Referência de múltiplas bases de dados (SILVA,Greengenes,RDP,Unite)
(3) Sondas concebidas para resistência a medicamentos, virulência e genes relacionados.
As amostras de RNA podem ser usadas diretamente para a preparação de bibliotecas com este kit?
Não. Este kit só é compatível com gDNA ou cDNA como amostras iniciais. Para amostras de ARN, é necessária a transcrição inversa para gerar cADN antes da preparação da biblioteca.
Qual é o intervalo de entrada recomendado? Como lidar com entradas que excedam este intervalo?
Este kit suporta 50-2.000 ng de gDNA ou cDNA. Se a quantidade de entrada exceder 2.000 ng, dividir a amostra em várias reacções para manter a eficiência da amplificação.
Qual é o tamanho da inserção deste kit? Como selecionar o comprimento da leitura de sequenciação?
O pico principal dos produtos PCR utilizando este kit é de ~270 bp. A sequenciação PE150 é recomendada para uma cobertura de alta qualidade.
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