Kit de reagentes em solução NanOnco Plus Panel v3.0

para pesquisade diagnósticopara gene HLA-B

O NanOnco Plus Panel v3.0 tem como alvo as regiões codificadoras completas de 620 genes (incluindo genes HLA) de interesse em estudos de tumores sólidos, uma série de regiões intrónicas relacionadas com fusões comuns, sequências clássicas de microssatélites e loci polimórficos associados à quimioterapia. Este painel envolve um número total de 637 genes, cobrindo uma região alvo do genoma de aproximadamente 2,4 Mb. Permite o enriquecimento de múltiplas variantes, incluindo a substituição de bases, a inserção/deleção, o rearranjo de genes, a amplificação de genes, a instabilidade de microssatélites, etc. As amostras de ARN podem ser utilizadas diretamente para a preparação de bibliotecas com este kit? Não. Este kit só é compatível com gDNA ou cDNA como amostras iniciais. Para as amostras de ARN, é necessária a transcrição inversa para gerar cADN antes da preparação da biblioteca. Qual é o intervalo de entrada recomendado? Como lidar com entradas que excedam este intervalo? Este kit suporta 50-2.000 ng de gDNA ou cDNA. Se a quantidade de entrada exceder 2.000 ng, dividir a amostra em várias reacções para manter a eficiência da amplificação. Qual é o tamanho da inserção deste kit? Como selecionar o comprimento da leitura de sequenciação? O pico principal dos produtos PCR utilizando este kit é de ~270 bp. A sequenciação PE150 é recomendada para uma cobertura de alta qualidade. Qual é o volume de dados de sequenciação recomendado para a análise do repertório imunitário IGTR? Recomenda-se um mínimo de 0,3 Gb para detetar clones a 0,01% de abundância com uma entrada de 200 ng. Aumente o volume de dados para aumentar a sensibilidade para clones de baixa frequência.