Kit de reagentes em solução OncoFu Elite v1.0

para pesquisapara análise de RNA

O OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 tem como alvo 105 genes que são os mais comuns ou relevantes para fusões clinicamente significativas em estudos de tumores sólidos. As sondas abrangem todas as regiões codificadoras de transcritos e algumas regiões UTR envolvidas na ocorrência de fusões que estão oficialmente incluídas no RefSeq 109. O painel suporta o enriquecimento de informação sobre fusões, mutações e expressão genética ao nível do ARN. As amostras de ARN podem ser utilizadas diretamente para a preparação de bibliotecas com este kit? Não. Este kit é compatível apenas com gDNA ou cDNA como amostras iniciais. Para amostras de ARN, é necessária a transcrição inversa para gerar cADN antes da preparação da biblioteca. Qual é o intervalo de entrada recomendado? Como lidar com entradas que excedam este intervalo? Este kit suporta 50-2.000 ng de gDNA ou cDNA. Se a quantidade de entrada exceder 2.000 ng, dividir a amostra em várias reacções para manter a eficiência da amplificação. Qual é o tamanho da inserção deste kit? Como selecionar o comprimento da leitura de sequenciação? O pico principal dos produtos PCR utilizando este kit é de ~270 bp. A sequenciação PE150 é recomendada para uma cobertura de alta qualidade. Qual é o volume de dados de sequenciação recomendado para a análise do repertório imunitário IGTR? Recomenda-se um mínimo de 0,3 Gb para detetar clones a 0,01% de abundância com uma entrada de 200 ng. Aumente o volume de dados para aumentar a sensibilidade para clones de baixa frequência. Este kit é adequado para a monitorização da doença residual mínima (DRM)? Sim. Este kit inclui IG Primer Mix e TR Primer Mix com primers específicos do gene fornecidos em tubos separados, permitindo uma combinação flexível numa única reação de amplificação.