O HiSNP Ultra Panel v1.0 foi concebido para analisar o estado da composição genómica com alta resolução. Este painel baseado no esqueleto SNP pode analisar todo o genoma com 50 Kb de distância, visando mais de 52.000 sítios SNP de MAF elevado.
O painel HiSNP v1.0 foi concebido para analisar o estado da composição genómica com uma resolução básica. Este painel baseado no esqueleto SNP pode analisar todo o genoma com 300 Kb de distância, visando mais de 9.000 sítios SNP de MAF elevado.
Caraterísticas
Elevado rácio de heterozigotia: Conceção abrangente para europeus, africanos, americanos e asiáticos (AF=0,05-0,95)
Desempenho de captura estável: GC equilibrado; sequência de flanco única (verificada por WGS)
Proporcionalidade adequada: Distribuição uniforme em todo o genoma; sítios LD excluídos
Compatibilidade superior: Utilizar isoladamente ou em conjunto com outros painéis CDS
As amostras de ARN podem ser utilizadas diretamente para a preparação de bibliotecas com este kit?
Não. Este kit é compatível apenas com gDNA ou cDNA como amostras iniciais. Para as amostras de ARN, é necessária a transcrição inversa para gerar cADN antes da preparação da biblioteca.
Qual é o intervalo de entrada recomendado? Como lidar com entradas que excedam este intervalo?
Este kit suporta 50-2.000 ng de gDNA ou cDNA. Se a quantidade de entrada exceder 2.000 ng, dividir a amostra em várias reacções para manter a eficiência da amplificação.
Qual é o tamanho da inserção deste kit? Como selecionar o comprimento da leitura de sequenciação?
O pico principal dos produtos PCR utilizando este kit é de ~270 bp. A sequenciação PE150 é recomendada para uma cobertura de alta qualidade.
Qual é o volume de dados de sequenciação recomendado para a análise do repertório imunitário IGTR?
Recomenda-se um mínimo de 0,3 Gb para detetar clones a 0,01% de abundância com uma entrada de 200 ng.
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