O NanOnCT Panel v1.0 é um painel compacto concebido para a análise de tumores sólidos e biópsia líquida. Este painel envolve um número total de 69 genes com regiões selecionadas cobertas. Com um design de sonda optimizado, este painel oferece uma cobertura altamente uniforme sobre as regiões alvo tanto para FFPE como para ADN sem células.
As amostras de ARN podem ser utilizadas diretamente para a preparação de bibliotecas com este kit?
Não. Este kit é compatível apenas com gDNA ou cDNA como amostras iniciais. Para amostras de ARN, é necessária a transcrição inversa para gerar cADN antes da preparação da biblioteca.
Qual é o intervalo de entrada recomendado? Como lidar com entradas que excedam este intervalo?
Este kit suporta 50-2.000 ng de gDNA ou cDNA. Se a quantidade de entrada exceder 2.000 ng, dividir a amostra em várias reacções para manter a eficiência da amplificação.
Qual é o tamanho da inserção deste kit? Como selecionar o comprimento da leitura de sequenciação?
O pico principal dos produtos PCR utilizando este kit é de ~270 bp. A sequenciação PE150 é recomendada para uma cobertura de alta qualidade.
Qual é o volume de dados de sequenciação recomendado para a análise do repertório imunitário IGTR?
Recomenda-se um mínimo de 0,3 Gb para detetar clones a 0,01% de abundância com uma entrada de 200 ng. Aumente o volume de dados para aumentar a sensibilidade para clones de baixa frequência.
Este kit é adequado para a monitorização da doença residual mínima (DRM)?
Sim. Este kit inclui IG Primer Mix e TR Primer Mix com primers específicos de genes fornecidos em tubos separados, permitindo uma combinação flexível numa única reação de amplificação. Com a sua elevada sensibilidade, o kit cumpre os requisitos para o desenvolvimento de tecnologia de monitorização de MRD e aplicações clínicas, tornando-o ideal para cenários de deteção de variantes de baixa frequência.
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