O LungCancer Panel v1.0 foi especificamente concebido para a investigação do cancro do pulmão. Este painel envolve 24 genes, incluindo regiões codificadoras completas de 19 genes e regiões não exónicas com ocorrência frequente de fusão no cancro do pulmão.
As amostras de ARN podem ser utilizadas diretamente para a preparação de bibliotecas com este kit?
Não. Este kit só é compatível com gDNA ou cDNA como amostras iniciais. Para as amostras de ARN, é necessária a transcrição inversa para gerar cADN antes da preparação da biblioteca.
Qual é o intervalo de entrada recomendado? Como lidar com entradas que excedam este intervalo?
Este kit suporta 50-2.000 ng de gDNA ou cDNA. Se a quantidade de entrada exceder 2.000 ng, dividir a amostra em várias reacções para manter a eficiência da amplificação.
Qual é o tamanho da inserção deste kit? Como selecionar o comprimento da leitura de sequenciação?
O pico principal dos produtos PCR utilizando este kit é de ~270 bp. A sequenciação PE150 é recomendada para uma cobertura de alta qualidade.
Qual é o volume de dados de sequenciação recomendado para a análise do repertório imunitário IGTR?
Recomenda-se um mínimo de 0,3 Gb para detetar clones a 0,01% de abundância com uma entrada de 200 ng. Aumente o volume de dados para aumentar a sensibilidade para clones de baixa frequência.
Este kit é adequado para a monitorização da doença residual mínima (DRM)?
Sim. Este kit inclui IG Primer Mix e TR Primer Mix com primers específicos de genes fornecidos em tubos separados, permitindo uma combinação flexível numa única reação de amplificação. Com a sua elevada sensibilidade, o kit cumpre os requisitos para o desenvolvimento de tecnologia de monitorização de MRD e aplicações clínicas, tornando-o ideal para cenários de deteção de variantes de baixa frequência.
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