Todas as bactérias e archaea contêm uma subunidade ribossómica conhecida como 16S, com cerca de 1500 nucleótidos de comprimento e nove regiões hipervariáveis (V1-V9) distribuídas por regiões altamente conservadas que são específicas do género ou da espécie. A sequenciação do gene 16S do RNA ribossómico (rRNA), um marcador genético estabelecido, é o padrão de ouro para a análise de amostras bacterianas para identificação e classificação de culturas puras e análise de amostras mistas. Com a introdução da sequenciação de nova geração (NGS), o método do ARN ribossómico 16S é agora também amplamente utilizado para deconvoluir comunidades microbianas complexas, como os microbiomas do intestino humano.
A região V1-V9 é mais capaz de distinguir espécies bacterianas do que outras sub-regiões. O EasySeq™ 16S rRNA V1-V6 e V9 Bacterial ID fornece a análise completa das regiões variáveis V1-6 e V9 do gene 16S rRNA bacteriano. Este kit suporta uma estratégia de identificação bacteriana orientada por NGS para doenças infecciosas, investigação de contaminação e testes de análise da causa raiz a partir de amostras clínicas.
Compatibilidade do kit e da plataforma
Nota: O EasySeq™ 16S rRNA V1-6 e V9 Bacterial ID NGS Library Prep Kit foi concebido para sequenciar as regiões hipervariáveis V1-V6 e V9 numa reação multiplex utilizando dois painéis de sondas diferentes. Isto requer duas placas de índice duplo exclusivas para utilização associada.
O EasySeq™ 16S rRNA V1-6 e V9 Bacterial ID Sequencing Kit é utilizado com ADN extraído de culturas puras e também permite a amplificação direta de ADN a partir de materiais clínicos.
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