Uma vez que a preparação de amostras para sequenciação de nova geração (NGS) implica uma multiplicidade de passos e cada passo é fundamental para o sucesso e a eficiência global da sequenciação, todos os passos têm de ser optimizados em termos de reagentes e protocolo. Considerando a natureza preciosa das amostras NGS, é necessário um fluxo de trabalho integrado com reagentes optimizados para converter as amostras numa biblioteca pronta para sequenciação. Os tipos de amostras NGS podem diferir em termos de:
Facilidade de sequenciação - uniforme ou com estruturas secundárias ou áreas ricas em GC
Qualidade - recém-extraídas ou preservadas (formalina fixada e embebida em parafina - FFPE)
Fluxos de trabalho flexíveis - fluxos de trabalho de ADN e ARN optimizados para aplicações
Tendo em conta todas estas variações, é importante utilizar reagentes de preparação de bibliotecas que possam trabalhar eficazmente com todos estes tipos de amostras. Os reagentes de preparação de bibliotecas de alta qualidade ajudam a obter uma cobertura uniforme e melhorada, bem como taxas de duplicação mais baixas. Dependendo do objetivo final (por exemplo, sequenciação do exoma completo), pode também ser necessário um passo de enriquecimento do alvo para enriquecer regiões específicas de interesse. A utilização de reagentes de enriquecimento de alvos de elevada eficiência ajuda a obter uma cobertura uniforme e de elevada profundidade, com elevada especificidade (taxa de acerto no alvo) nas regiões visadas.
O fluxo de trabalho KAPA HyperPETE combina produtos validados para a preparação de bibliotecas KAPA e o enriquecimento de alvos KAPA. Fornece todos os acessórios e reagentes necessários para a preparação de amostras, desde o ADN ou ARN até ao sequenciador, num fluxo de trabalho de um dia. Os novos painéis KAPA HyperPETE proporcionam uma elevada eficiência de captura, uniformidade de sequenciação com menos otimização e maior confiança na deteção de variantes.
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