FocuSCOPE™ é uma solução de sequenciação multi-células de alta capacidade que pode detectar tanto variantes genéticas como transcriptomas a partir das mesmas células únicas. Assim, FocuSCOPE™ forneceu uma ferramenta para decifrar a ligação entre genótipo e fenótipo a nível de uma única célula.
A tecnologia FocuSCOPE™ tem dois elementos-chave: micropartículas de codificação celular conjugadas com oligoelementos que podem capturar eficazmente tanto mRNA como as suas sequências de interesse; e química de reacção optimizada para amplificação e construção de biblioteca tanto de sequências de mRNA como de sequências de regiões alvo. FocuSCOPE™ tem sido utilizado para realizar com sucesso a análise de células únicas de perfis de expressão genética e mutações pontuais, genes de fusão, ou sequências virais intracelulares simultaneamente, a partir de milhares de células de cada vez. Os dados multi-económicos adquiridos proporcionaram uma visão mais abrangente de cada célula individual.
Contas desenhadas à medida exclusivas
Com os grânulos AccuraCellTM de concepção única da Singleron, podem ser capturadas simultaneamente até 5 áreas alvo, cada uma com menos de 200bp. Serão construídas duas bibliotecas a partir da mesma amostra, uma biblioteca para transcriptómica inteira com as sondas de politraçã (dT), uma biblioteca para as sequências alvo com sondas personalizadas. Portanto, a informação do tipo de célula, bem como as sequências alvo (mutação, gene de fusão, ou sequência viral), podem ser detectadas na mesma célula.
Detecção específica de mutações do condutor
Os kits FocuSCOPE® detectam as mutações do condutor a partir de tecidos heterogéneos com elevada especificidade. Num conjunto de dados de demonstração abaixo, a partir de uma mistura de três linhas celulares, a linha celular H1975 transporta a mutação pontual EGFR T790M, e a linha celular A549 transporta a mutação KRAS G12S.
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