Kit de reagentes em solução CLindex™

para preparação de bancos de DNAde preparação de bancos de RNA

CLindex™Sample kit de multiplexagem permite o agrupamento de até 16 amostras na mesma biblioteca de sequenciação de células individuais. A tecnologia de multiplexagem CLindex™ emprega a química de clique para uma etiquetagem de amostras eficiente e imparcial. Um grupo químico com alta afinidade com as proteínas da superfície celular e uma ligação de oligo de indexação de amostra a esse grupo químico rotulam as células de cada amostra. Uma grande vantagem da etiquetagem baseada na química do clique em comparação com a etiquetagem baseada em anticorpos é que as proteínas da superfície celular reconhecidas pela química do clique são abundantes e encontradas em diferentes espécies. Além disso, todo o processo de etiquetagem da amostra demora apenas 30 minutos. Fluxo de trabalho racionalizado As etiquetas de amostras são adicionadas utilizando a química do clique antes da reunião de amostras num único fluxo de trabalho GEXSCOPE®. As células agrupadas com etiquetas de amostras são então carregadas num SCOPE-chip™ para lise celular e código de barras. A etiqueta da amostra (15nt) é ladeada por um cabo universal de PCR e um poli(A)-tail, que são capturados por contas oligo-dT. As etiquetas das amostras são etiquetadas com um código de barras de células. Simultaneamente, os mRNAs da mesma célula única são também capturados pelos grânulos magnéticos de oligo-dT no seu poli(A)-tail e etiquetados com o mesmo código de barras de célula, bem como UMI. Assim, todos os fragmentos de cDNA da mesma célula têm um denominador comum: o código de barras da célula. Tanto o código de barras da célula como a etiqueta CLindex asseguram que cada transcrição pode ser ligada de volta à célula e à amostra de origem. Alta eficiência de etiquetagem Quatro linhas de células independentes (NB4, THP1, U937 e CCRF) foram rotuladas usando CLindex® e agrupadas em partes iguais antes da partição de células no SCOPE-chip®.