Usando a tecnologia GEXSCOPE® da Singleron, as células individuais são divididas em micropoços individuais, e os mRNAs são capturados por esferas com códigos de barras únicos. Os mRNA são então transcritos ao contrário em cDNA, seguido de um passo de circularização introduzido por uma pega circular. Através da circularização do cDNA, a região V(D)J foi aproximada do primer de sequenciação. Após duas rondas de enriquecimento, os produtos serão fragmentados e construídos para a biblioteca VDJ a todo o comprimento para a sequenciação de leitura curta de iluminina.
Elevada eficiência de captura de ARN e especificidade V(D)J
A recombinação VDJ é o processo pelo qual as células T e B reúnem aleatoriamente diferentes segmentos de genes - conhecidos como genes variáveis (V), diversidade (D) e união (J) - a fim de gerar receptores únicos (conhecidos como receptores de antigénios) que podem colectivamente reconhecer muitos tipos diferentes de moléculas. A região V(D)J é uma das regiões mais diversificadas do genoma humano, contribuindo para respostas imunitárias humanas complexas. Assim, a compreensão das sequências de comprimento total das células T e B das regiões V(D)J proporcionou uma compreensão mais precisa dos processos imunitários.
Destaques:
- Abrangente - combinar o perfil transcriptome com sequências completas de TCR ou BCR
- Alto rendimento - processar simultaneamente até 10.000 células numa única execução
- Alta taxa de mapeamento - aumentar a proporção de células com sequências V(D)J de comprimento total
- Alta eficiência de captura - tire partido da robusta captura de poliA
Aplicações
01
Microambiente Imune
Células T e B de Tumor Infiltrating
02
Doenças auto-imunes
Identificar células T e B anormais no Sistema Imune
03
Transplantação
Identificar os riscos de rejeição para transplante
---