O software NextGENe é o parceiro analítico perfeito para a análise dos dados de sequenciação do ambiente de trabalho produzidos pelos sistemas Illumina® iSeq, Miniseq, MiSeq, NextSeq, HiSeq, e NovaSeq, Ion Torrent Ion GeneStudio S5, PGM, e Proton, bem como por outras plataformas.
O software NextGENe é executado num Sistema Operativo Windows®, que fornece uma interface 'point & click' amigável aos biologistas. Não requer scripting ou outro suporte bioinformático, que são frequentemente necessários quando se utilizam programas tais como CLC Genomics Workbench, Lasergene's SeqMan Pro, bem como software académico como MAQ & SOAP, Top Hat, BWA & Bowtie.
O software NextGENe emprega tecnologias únicas específicas de plataforma num pacote multi-aplicação independente. O software NextGENe contém módulos de análise para:
Detecção SNP/Indel
Germline
Somatic
Captura de Exomas, Sequenciação de Exomas inteiras (WES)
Sequenciação do Genoma Inteiro (WGS)
Análise de Variantes Estruturais (incluindo detecção de genes de fusão)
Comparações baseadas na família e Trio
Comparações tumoral-normal
Detecção da variação do número de cópias (CNV) e alternativa ao rastreio do tipo MLPA
de novo assembléia
Transcriptome; Análise de Emendas Alternativas e Níveis de Expressão de Transcript
ChIP-Seq, Expressão Digital de Gene (DGE), Análise e Quantificação miRNA e Metagenómica
O software NextGENe é concebido num ambiente Windows® amigo dos biólogos, reduzindo significativamente a necessidade de recursos e custos adicionais de bioinformática. O software NextGENe utiliza hardware de baixo custo baseado em SO Windows® de 64 bits. (Clique aqui para configuração de hardware sugerida)
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