O RNA-seq de célula única permite aos investigadores estudar a forma como os padrões de expressão genética variam nas populações de células. A Takara Bio desenvolveu ferramentas robustas para realizar o RNA-seq em células individuais isoladas no sistema de circuito fluídico integrado (IFC) da Fluidigm. A química sensível do SMARTer dos nossos kits de entrada ultrabaixa, combinada com a capacidade de automação de alto rendimento do sistema Fluidigm C1, oferece percepções de alta resolução para a análise do transcriptoma.
Atualmente, oferecemos duas gerações de kits de mRNA-seq de célula única para o sistema Fluidigm C1 Single Cell Auto Prep. A versão mais recente, o SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit para o sistema Fluidigm C1, incorpora características do nosso kit SMART-Seq v4, líder de mercado, incluindo as tecnologias SMART (Switching Mechanism at 5' End of RNA Template) e de ácido nucleico bloqueado (LNA), que são coletivamente referidas como "SMARTer-seq® chemistry". Este kit supera os protocolos publicados e a nossa versão anterior, o SMARTer Ultra Low RNA Kit para o Fluidigm C1 System, proporcionando uma maior sensibilidade, melhor reprodutibilidade e uma melhor representação dos genes ricos em GC e AT. O novo script para utilização deste kit é suportado pelo mRNA Seq IFC e pelo Open App IFC, e pode ser descarregado através do Fluidigm Script Hub.
Visão geral
A tecnologia LNA baseada na tecnologia SMART melhorada no oligo SMART-Seq v4 e a química melhorada conduzem a um melhor desempenho (maior sensibilidade, maior reprodutibilidade e mais genes ricos em GC detectados).
Construção da biblioteca em 2 dias - O protocolo de síntese de cDNA demora aproximadamente duas horas, seguido do guião SMART-Seq v4 de oito horas no instrumento C1.
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