Kit de reagentes de esferas magnéticas SMARTer®

para sequenciamento de RNA de célula únicade proteínas

O SMARTer Target RNA Capture for Illumina é um sistema completo concebido para gerar cDNA a partir de RNA total enriquecido. O RNA-seq alvo pode superar vários desafios inerentes à amplificação de transcriptoma total (WTA) experiências de RNA-seq, melhorando a cobertura de sequência e a sensibilidade de detecção de transcrições de interesse que podem estar presentes em pequenas quantidades. As abordagens de RNA-seq direccionadas são também vantajosas para poupar custos e simplificar a análise. O enriquecimento das transcrições de interesse antes da síntese de cDNA permite a captura de informação sobre transcrições que de outra forma poderiam faltar ou exigir um número muito maior de leituras sequenciais para serem detectadas, incluindo fusões de genes quiméricos, isoformas de transcrição, e variantes de emendas. Ao melhorar a sensibilidade, o poder de análise é também melhorado, como se pode ver numa redução da relação sinal/ruído. SMARTer Target RNA Capture for Illumina é utilizado para gerar cDNA a partir de transcrições de RNA enriquecido. As sondas de ADN biotinilado específicas do alvo concebidas pelo utilizador são hibridizadas para transcrições de interesse e os híbridos de RNA-DNA resultantes são capturados com Contas de Captura. Este kit tira partido da sensibilidade do kit SMART-Seq® v4 Ultra® Low Input RNA Kit for Sequencing, para gerar cDNA de alta qualidade e de comprimento total a partir destas transcrições enriquecidas. O kit foi testado com 10 ng de RNA total, e foi demonstrado que executa a síntese de cDNA a partir de transcrições enriquecidas derivadas de apenas 100 pg de RNA total purificado. As bibliotecas de cDNA geradas por este kit foram testadas para compatibilidade com plataformas de sequenciação Illumina. Este método não requer métodos ou kits adicionais de remoção do rRNA.