Kit de reagentes de esferas magnéticas SMARTer®

para sequenciamento de RNA de célula únicade proteínas

O SMARTer Target RNA Capture for Illumina é um sistema completo concebido para gerar cDNA a partir de RNA total enriquecido. O RNA-seq direcionado pode ultrapassar vários desafios inerentes às experiências de RNA-seq de amplificação de todo o transcriptoma (WTA), melhorando a cobertura das sequências e a sensibilidade da deteção de transcritos de interesse que podem estar presentes em quantidades reduzidas. As abordagens de RNA-seq direcionado são também vantajosas em termos de poupança de custos e de simplificação da análise. O enriquecimento de transcritos de interesse antes da síntese de cDNA permite a captura de informações sobre transcritos que, de outra forma, poderiam passar despercebidos ou exigir um número muito maior de leituras de sequenciação para serem detectados, incluindo fusões de genes quiméricos, isoformas de transcritos e variantes de emenda. Ao melhorar a sensibilidade, o poder de análise também é melhorado, como se vê na redução da relação sinal/ruído. No fluxo de trabalho SMARTer Target RNA Capture for Illumina, o ARN total é hibridado com sondas de ADN biotinilado concebidas pelo utilizador em menos de quatro horas e, em seguida, purificado antes da captura em esferas de captura - partículas magnéticas revestidas com estreptavidina. As esferas de captura foram selecionadas porque apresentam uma adsorção especialmente baixa de proteínas e ácidos nucleicos e não interferem com as reacções a jusante, como a PCR ou a transcrição inversa, tornando possível realizar a síntese de cDNA nas amostras visadas enquanto estas permanecem ligadas às esferas. As esferas de captura são fornecidas como parte do kit SMARTer Target RNA Capture for Illumina e também são vendidas separadamente.