Como as novas tecnologias de coloração como a citometria de massa de imagem (IMC™, Standard BioTools) e os painéis fluorescentes de alta intensidade (Akoya PhenoCycler®) alargam as nossas capacidades de interrogar o microambiente tumoral usando a biologia espacial, encontrar diferenças significativas nos seus dados torna-se um desafio.
O nosso fluxo de trabalho de ponta a ponta para todas as suas necessidades de análise de imagens multiplexadas contém todos os passos num único software:
Visualizar
Importar imagens de todos os principais formatos de imagem multiplex (Akoya Biosciences, Standard BioTools, Lunaphore, Rarecyte, Ionpath, Canopy Biosciences, Olympus, Zeiss e mais). Definir grupos de canais de cor definidos pelo utilizador de combinações de biomarcadores e alternar facilmente entre eles para uma rápida visualização dos tipos de células/grupos de marcadores e CQ da imagem inicial. Atribuir cores a canais individuais ou grupos de canais e rever cada canal para se certificar de que contém bons dados. Excluir canais individuais das análises a jusante durante uma etapa de CQ.
Classificar Tecido
Utilizar a segmentação de tecidos à base de AI de Tinta para Trem em qualquer combinação de marcadores para detectar regiões morfológicas da amostra: tumor, estroma, necrose, artefactos, etc. Utilizar estas regiões para melhor informar a localização de populações imunitárias e outras populações celulares em relação ao tumor, estroma, etc. Dividir ainda mais o tumor em subregiões, excluir automaticamente áreas não relevantes (lâmina em branco, artefactos, etc.) e criar margens em torno de regiões específicas de interesse, por exemplo, para definir uma frente tumoral invasiva.
Detectar Células
Utilizar os nossos algoritmos de detecção nuclear e segmentação celular baseados em aprendizagem profunda pré-treinados para fluorescência (DAPI) e citometria de massa de imagem (canais de DNA-Iridium). Se tiver requisitos especiais para a sua detecção de células,
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