Software hospitalar LD1

para LAMPde designde compartilhamento

Evitar automaticamente a homologia e a estrutura de modelos Opções de BLAST local e de secretária Recuperação automática de sequências Visualização de sequências Calculadora de primers Gestão de dados e bases de dados Gerar relatório Sobre o LAMP Designer A OptiGene oferece uma aplicação de software que é utilizada para conceber primers eficientes para ensaios de Amplificação Isotérmica Mediada por Loop, ou LAMP. O LAMP é um método de amplificação isotérmica do ADN inventado pela Eiken Chemical Company Ltd do Japão e pode ser utilizado para amplificar algumas cópias de ADN para 109 cópias em apenas 30 minutos. A LAMP acoplada à transcrição inversa também pode ser aplicada para amplificar sequências de ARN. A LAMP utiliza seis iniciadores especialmente concebidos que reconhecem oito regiões distintas no ADN alvo e a conceção destes seis iniciadores é fundamental para o êxito do ensaio. O LAMP Designer recupera lotes de sequências de genes diretamente para o programa a partir de fontes em linha, como o GenBank. A aplicação pode efetuar uma pesquisa BLAST para evitar homologias cruzadas durante a conceção dos primers. Também suporta as opções BLAST Local e Desktop para utilizar bases de dados personalizadas e não publicadas. O LAMP Designer incorpora uma vista de sequência com primers marcados na sequência e calcula uma temperatura de fusão, Tm, utilizando a teoria termodinâmica do vizinho mais próximo e valores de SantaLucia altamente precisos. O software também exporta um relatório de qualidade de publicação para os ensaios concebidos para partilha com colegas. Os dados são organizados em formato de projeto e é mantida uma base de dados local de informações sobre a sequência e os resultados da pesquisa. Evitar homologias cruzadas O LAMP Designer interpreta automaticamente os resultados da pesquisa BLAST